52ヘルツのクジラとは、他のクジラが聞き取れない高い周波數(shù)で鳴く世界で一匹だけのクジラ。何も屆かない、何も屆けられない。そのためこの世で一番孤獨(dú)だと言われている。自分の人生を家族に搾取されてきた女性?貴瑚と、母に虐待され「ムシ」と呼ばれる少年。孤獨(dú)ゆえ愛を欲し、裏切られてきた彼らが出會い、新たな魂の物語が生まれる――。