本作主人公岡部倫太郎(宮野真守配音)是個(gè)患有嚴(yán)重中二病的大學(xué)生,自稱為“鳳凰院兇真”的他和伙伴們組成了“未來發(fā)明研究所”,在位于秋葉原的一個(gè)簡陋實(shí)驗(yàn)室內(nèi)進(jìn)行各種古怪發(fā)明和調(diào)查。2010年7月28日這天,岡部和青梅竹馬真由理(花澤香菜配音)一同去了科學(xué)講義會(huì)場,在那里,他們遇見了天才少女牧瀨紅莉棲(今井麻美配音)。讓人意想不到的事情發(fā)生了,岡部在會(huì)館樓道內(nèi)聽到一聲慘叫,他聞聲而至,發(fā)現(xiàn)了倒在血泊中的牧瀨。岡部用手機(jī)短信將這件事告訴好友橋田至,這個(gè)舉動(dòng),讓世界都顛覆了。實(shí)驗(yàn)室里那個(gè)所謂的“未來道具”,竟然真的可以左右世界的進(jìn)程,岡部自此成了孤獨(dú)的觀測者。這一切都是命運(yùn)石之門的選擇。