故事發(fā)生在一所名叫第3新東京世立NERV學園中,校長是嚴肅又寡言的碇原度(立木文彥 配音)。作為校長的兒子,碇真嗣(緒方惠美 配音)感到壓力很大。于此同時,來自外國的紅發(fā)轉學生明日香(宮村優(yōu)子 配音),分裂成三個、以姐妹的形式出場的凌波麗(林原惠美 配音)都給碇真嗣的學校生活帶來了翻天覆地的變化。此外,在原作中高大帥氣的初號機,也將以嬌小可愛的形象,作為學院的一份子出現(xiàn)在動畫中。 動畫以《新世界福音戰(zhàn)士》中的角色為原型,一改原作沉重嚴肅的氣氛,描述了輕松愉快的校園生活。制作方首次采用了3D的Q版造型,配以實景背景和2D拼接,造就了多元化的繪畫風格。